ich hatte den selben fehler im IE, dann hab ich hochgescrollt und bemerkt,m dass der Hintergrund genau die Bildschirmgröße ist aber nicht mitscrollt. Dann habe ich in der CSS den Hintergrund (overlay) die position:absolute auf position:fixed gestellt und jetzt scrollt der hintergrund mit.
So einfach ist das Manchmal. Hier nochmal die CSS.
#lightbox{ position: absolute; left: 0; width: 100%; z-index: 100; text-align: center; line-height: 0;}

#lightbox img{ width: auto; height: auto;}

#lightbox a img{ border: none; }

#outerImageContainer{ position: relative; background-color:
#fff; width: 250px; height: 250px; margin: 0 auto; }

#imageContainer{ padding: 10px; }

#loading{ position: absolute; top: 40%; left: 0%; height: 25%; width: 100%; text-align: center; line-height: 0; }

#hoverNav{ position: absolute; top: 0; left: 0; height: 100%; width: 100%; z-index: 10; }

#imageContainer>
#hoverNav{ left: 0;}
#hoverNav a{ outline: none;}

#prevLink,
#nextLink{ width: 49%; height: 100%; background-image: url(data:image/gif;base64,AAAA); /* Trick IE into showing hover */ display: block; }

#prevLink { left: 0; float: left;}
#nextLink { right: 0; float: right;}

#prevLink:hover,
#prevLink:visited:hover { background: url(images/prevlabel.gif) left 15% no-repeat; }

#nextLink:hover,
#nextLink:visited:hover { background: url(images/nextlabel.gif) right 15% no-repeat; }

#imageDataContainer{ font: 10px Verdana, Helvetica, sans-serif; background-color:
#fff; margin: 0 auto; line-height: 1.4em; overflow: auto; width: 100% ; }

#imageData{ padding:0 10px; color: #666; }

#imageData
#imageDetails{ width: 70%; float: left; text-align: left; }

#imageData #caption{ font-weight: bold; }

#imageData
#numberDisplay{ display: block; clear: left; padding-bottom: 1.0em; }

#imageData #bottomNavClose{ width: 66px; float: right; padding-bottom: 0.7em; outline: none;}

#overlay{ position: fixed; top: 0; left: 0; z-index: 90; width: 100%; height: 100%; background-color: #000; }

1. macht ihr das:

und
2. ändert ihr in der neu kopierten und umbenannten Datei ‘lightboxie.css’ in Zeile 41

von
#imageContainer>#hoverNav{ left: 0;}
zu
#imageContainer #hoverNav{ left: 0;}

ich habe die lightbox++ und zwar von dieser Quelle

http://blog.codefidelity.com/

und zwar von folgender Seite:

http://www.lokeshdhakar.com/projects/lightbox2/

da gibt es auch keine
‘lightbox.js’
sondern eine
‘lightbox++.js’